Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDRD3Q9H7E2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TDRD3Q9H7E2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TDRD3Q9H7E2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TDRD3Q9H7E2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD3Q9H7E2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD3Q9H7E2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD3Q9H7E2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD3Q9H7E2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD3Q9H7E2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD3Q9H7E2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD3Q9H7E2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD3Q9H7E2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD3Q9H7E2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD3Q9H7E2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD3Q9H7E2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD3Q9H7E2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD3Q9H7E2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD3Q9H7E2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD3Q9H7E2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD3Q9H7E2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD3Q9H7E2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD3Q9H7E2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD3Q9H7E2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms