Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms