Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms