Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms