Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SHANK3Q9BYB0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms