Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PACSIN1Q9BY11 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PACSIN1Q9BY11 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms