Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms