Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms