Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms