Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3BQ9BS92 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms