Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms