Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
FYCO1Q9BQS8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms