Protein–RNA interactions for Protein: Q99865

SPIN2A, Spindlin-2A, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2AQ99865 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIN2AQ99865 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms