Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms