Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRAMP1Q96RY5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms