Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms