Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms