Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms