Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPNQ96H22 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms