Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE2Q96FN4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms