Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDC3Q96F86 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC3Q96F86 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms