Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC51Q96ER9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC51Q96ER9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC51Q96ER9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC51Q96ER9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC51Q96ER9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC51Q96ER9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC51Q96ER9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC51Q96ER9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC51Q96ER9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC51Q96ER9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms