Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms