Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC59Q96AG4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LRRC59Q96AG4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LRRC59Q96AG4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC59Q96AG4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC59Q96AG4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC59Q96AG4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC59Q96AG4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC59Q96AG4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC59Q96AG4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC59Q96AG4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC59Q96AG4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms