Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms