Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms