Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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