Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRUQ92729 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms