Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113Q902F9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms