Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf3Q8WVX3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms