Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HJURPQ8NCD3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms