Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM87AQ8NBN3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms