Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms