Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC155Q8N6L0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms