Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms