Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms