Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ13

ZBED8, Protein ZBED8, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8Q8IZ13 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED8Q8IZ13 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED8Q8IZ13 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED8Q8IZ13 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED8Q8IZ13 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED8Q8IZ13 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED8Q8IZ13 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms