Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX29P2Q8IUI4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms