Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT25Q7Z3Z0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms