Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM47EQ6ZV65 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms