Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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