Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRSAM1Q6UWE0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms