Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms