Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L8

SHC4, SHC-transforming protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC4Q6S5L8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHC4Q6S5L8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHC4Q6S5L8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms