Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6P435 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6P435 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6P435 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6P435 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6P435 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6P435 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6P435 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6P435 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6P435 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6P435 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6P435 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6P435 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6P435 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6P435 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6P435 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6P435 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6P435 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6P435 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6P435 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6P435 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6P435 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6P435 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6P435 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6P435 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6P435 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6P435 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6P435 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6P435 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6P435 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6P435 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6P435 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6P435 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6P435 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6P435 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6P435 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6P435 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6P435 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6P435 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6P435 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6P435 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6P435 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6P435 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6P435 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6P435 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6P435 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6P435 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6P435 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6P435 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6P435 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6P435 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6P435 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6P435 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6P435 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6P435 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6P435 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6P435 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6P435 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6P435 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6P435 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6P435 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6P435 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6P435 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6P435 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6P435 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6P435 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6P435 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6P435 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6P435 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6P435 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6P435 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6P435 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6P435 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6P435 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6P435 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6P435 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6P435 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6P435 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6P435 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6P435 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6P435 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6P435 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6P435 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6P435 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6P435 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6P435 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6P435 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6P435 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6P435 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6P435 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6P435 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6P435 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6P435 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6P435 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6P435 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6P435 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6P435 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6P435 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6P435 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6P435 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms