Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC8

PPP1R18, Phostensin, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R18Q6NYC8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPP1R18Q6NYC8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R18Q6NYC8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms