Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC144NLQ6NUI1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms