Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEF1DP3Q658K8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EEF1DP3Q658K8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms