Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR78Q5VTH9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms