Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms